Изследователската дейност на проф. д-р Юрий Янакиев е фокусирана върху анализа на психосоциалните рискове, хроничния стрес, бърнаут синдрома и изграждането на устойчивост в образователни, здравни и организационни системи. Тези теми се изследват в рамките на национални и международни научни проекти, които служат като платформа за свързване на теоретични модели с емпирични данни и приложими решения.

Като ръководител и ключов научен експерт в проекти, финансирани от UNICEF, европейски програми и национални инициативи в образованието и психичното здраве, проф. Янакиев работи с интердисциплинарни екипи и мащабни извадки от педагогически и здравни специалисти. Проектната дейност е насочена към разработване и валидиране на инструменти за оценка на психосоциалния риск, професионалното прегаряне и резилиънса, както и към модели за ранна превенция и институционална подкрепа.

Резултатите от тези изследвания са публикувани в международни рецензирани научни списания с импакт фактор, като съществена част от тях интегрират психологическа оценка с анализ на биологични маркери на стрес, допринасяйки за интердисциплинарното разбиране на бърнаут синдрома и психичното здраве. 

Проектите и научните публикации формират последователна изследователска линия, в която научното познание се превежда в практики и политики с висока обществена значимост. Чрез този подход проф. Янакиев допринася за развитието на доказателствено базирани решения в областта на психичното здраве, образованието и организационното благополучие.

Паралелно с изследователската и проектната си дейност, проф. Янакиев развива активна преподавателска практика в областта на социалната психология, психичното здраве и невронауките. Преподаването е тясно свързано с текущите му научни изследвания и проекти, като учебните курсове интегрират съвременни емпирични данни, научни публикации и реални казуси от образователната и здравната практика. Този подход подпомага формирането на аналитично мислене, изследователска култура и професионална чувствителност у студентите.